Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms