Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms