Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBM2

Fam83b, Protein FAM83B, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83bQ0VBM2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fam83bQ0VBM2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam83bQ0VBM2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms