Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms