Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms