Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col17a1Q07563 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col17a1Q07563 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col17a1Q07563 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col17a1Q07563 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col17a1Q07563 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col17a1Q07563 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col17a1Q07563 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col17a1Q07563 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col17a1Q07563 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Col17a1Q07563 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col17a1Q07563 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Col17a1Q07563 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col17a1Q07563 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Col17a1Q07563 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col17a1Q07563 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col17a1Q07563 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Col17a1Q07563 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col17a1Q07563 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Col17a1Q07563 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col17a1Q07563 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col17a1Q07563 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col17a1Q07563 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col17a1Q07563 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col17a1Q07563 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col17a1Q07563 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms