Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf3Q07104 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf3Q07104 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf3Q07104 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf3Q07104 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms