Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox4Q06831 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms