Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf4Q06507 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms