Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrx2Q06348 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms