Protein–RNA interactions for Protein: Q05A36

Mex3c, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mex3cQ05A36 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mex3cQ05A36 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms