Protein–RNA interactions for Protein: Q05306

Col10a1, Collagen alpha-1(X) chain, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col10a1Q05306 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Col10a1Q05306 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Col10a1Q05306 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col10a1Q05306 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col10a1Q05306 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col10a1Q05306 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col10a1Q05306 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col10a1Q05306 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col10a1Q05306 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col10a1Q05306 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col10a1Q05306 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col10a1Q05306 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col10a1Q05306 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col10a1Q05306 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col10a1Q05306 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col10a1Q05306 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col10a1Q05306 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col10a1Q05306 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col10a1Q05306 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col10a1Q05306 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col10a1Q05306 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col10a1Q05306 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col10a1Q05306 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col10a1Q05306 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col10a1Q05306 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col10a1Q05306 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Col10a1Q05306 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col10a1Q05306 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col10a1Q05306 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col10a1Q05306 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col10a1Q05306 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col10a1Q05306 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col10a1Q05306 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col10a1Q05306 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col10a1Q05306 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col10a1Q05306 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col10a1Q05306 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms