Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms