Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxcr5Q04683 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxcr5Q04683 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxcr5Q04683 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms