Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 208 ms