Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cacna1sQ02789 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms