Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms