Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GscQ02591 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GscQ02591 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GscQ02591 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GscQ02591 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GscQ02591 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GscQ02591 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GscQ02591 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GscQ02591 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GscQ02591 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GscQ02591 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GscQ02591 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GscQ02591 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GscQ02591 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GscQ02591 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GscQ02591 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GscQ02591 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GscQ02591 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GscQ02591 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GscQ02591 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GscQ02591 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GscQ02591 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GscQ02591 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GscQ02591 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GscQ02591 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GscQ02591 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GscQ02591 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GscQ02591 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GscQ02591 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GscQ02591 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GscQ02591 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GscQ02591 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GscQ02591 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GscQ02591 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GscQ02591 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GscQ02591 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GscQ02591 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GscQ02591 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GscQ02591 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GscQ02591 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GscQ02591 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GscQ02591 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GscQ02591 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GscQ02591 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GscQ02591 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GscQ02591 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GscQ02591 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GscQ02591 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GscQ02591 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GscQ02591 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GscQ02591 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GscQ02591 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GscQ02591 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GscQ02591 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GscQ02591 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GscQ02591 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GscQ02591 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GscQ02591 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GscQ02591 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GscQ02591 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GscQ02591 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GscQ02591 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GscQ02591 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GscQ02591 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GscQ02591 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GscQ02591 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GscQ02591 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GscQ02591 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GscQ02591 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GscQ02591 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GscQ02591 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GscQ02591 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GscQ02591 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GscQ02591 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GscQ02591 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GscQ02591 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GscQ02591 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GscQ02591 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GscQ02591 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GscQ02591 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GscQ02591 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GscQ02591 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GscQ02591 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GscQ02591 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GscQ02591 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GscQ02591 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GscQ02591 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GscQ02591 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GscQ02591 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GscQ02591 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GscQ02591 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GscQ02591 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GscQ02591 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GscQ02591 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GscQ02591 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GscQ02591 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GscQ02591 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GscQ02591 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GscQ02591 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GscQ02591 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms