Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VcpQ01853 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VcpQ01853 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VcpQ01853 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VcpQ01853 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VcpQ01853 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VcpQ01853 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VcpQ01853 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms