Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EgfrQ01279 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms