Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gja5Q01231 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gja5Q01231 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms