Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col1a2Q01149 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col1a2Q01149 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms