Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb2Q00977 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms