Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb1Q00420 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms