Protein–RNA interactions for Protein: P97797

Sirpa, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SirpaP97797 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SirpaP97797 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SirpaP97797 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SirpaP97797 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SirpaP97797 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SirpaP97797 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SirpaP97797 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SirpaP97797 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms