Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AlkP97793 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AlkP97793 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AlkP97793 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AlkP97793 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AlkP97793 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AlkP97793 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AlkP97793 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AlkP97793 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AlkP97793 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AlkP97793 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AlkP97793 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AlkP97793 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AlkP97793 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AlkP97793 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AlkP97793 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AlkP97793 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AlkP97793 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AlkP97793 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AlkP97793 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AlkP97793 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AlkP97793 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AlkP97793 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AlkP97793 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AlkP97793 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AlkP97793 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AlkP97793 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AlkP97793 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AlkP97793 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
AlkP97793 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AlkP97793 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AlkP97793 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AlkP97793 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
AlkP97793 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AlkP97793 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AlkP97793 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AlkP97793 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AlkP97793 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AlkP97793 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AlkP97793 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AlkP97793 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AlkP97793 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AlkP97793 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AlkP97793 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AlkP97793 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AlkP97793 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AlkP97793 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AlkP97793 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AlkP97793 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AlkP97793 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AlkP97793 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AlkP97793 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AlkP97793 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AlkP97793 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AlkP97793 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AlkP97793 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AlkP97793 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AlkP97793 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AlkP97793 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
AlkP97793 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AlkP97793 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AlkP97793 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AlkP97793 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AlkP97793 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AlkP97793 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AlkP97793 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AlkP97793 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
AlkP97793 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AlkP97793 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AlkP97793 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AlkP97793 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AlkP97793 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AlkP97793 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
AlkP97793 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AlkP97793 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AlkP97793 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AlkP97793 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AlkP97793 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AlkP97793 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AlkP97793 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AlkP97793 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AlkP97793 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AlkP97793 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AlkP97793 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AlkP97793 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AlkP97793 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AlkP97793 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AlkP97793 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AlkP97793 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AlkP97793 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AlkP97793 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AlkP97793 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AlkP97793 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AlkP97793 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AlkP97793 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AlkP97793 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AlkP97793 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
AlkP97793 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AlkP97793 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AlkP97793 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms