Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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