Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
rp9P97762 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
rp9P97762 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
rp9P97762 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
rp9P97762 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
rp9P97762 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
rp9P97762 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
rp9P97762 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
rp9P97762 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
rp9P97762 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
rp9P97762 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
rp9P97762 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
rp9P97762 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
rp9P97762 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
rp9P97762 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
rp9P97762 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
rp9P97762 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
rp9P97762 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
rp9P97762 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
rp9P97762 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
rp9P97762 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
rp9P97762 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
rp9P97762 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
rp9P97762 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
rp9P97762 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
rp9P97762 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
rp9P97762 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
rp9P97762 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
rp9P97762 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
rp9P97762 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
rp9P97762 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
rp9P97762 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
rp9P97762 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
rp9P97762 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
rp9P97762 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
rp9P97762 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
rp9P97762 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
rp9P97762 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
rp9P97762 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
rp9P97762 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
rp9P97762 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
rp9P97762 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
rp9P97762 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
rp9P97762 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
rp9P97762 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
rp9P97762 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
rp9P97762 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
rp9P97762 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
rp9P97762 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
rp9P97762 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
rp9P97762 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
rp9P97762 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
rp9P97762 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
rp9P97762 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
rp9P97762 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
rp9P97762 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
rp9P97762 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
rp9P97762 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
rp9P97762 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
rp9P97762 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
rp9P97762 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
rp9P97762 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
rp9P97762 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
rp9P97762 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
rp9P97762 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
rp9P97762 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
rp9P97762 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
rp9P97762 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
rp9P97762 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
rp9P97762 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
rp9P97762 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
rp9P97762 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
rp9P97762 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
rp9P97762 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
rp9P97762 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
rp9P97762 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
rp9P97762 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
rp9P97762 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
rp9P97762 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
rp9P97762 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
rp9P97762 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
rp9P97762 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
rp9P97762 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
rp9P97762 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
rp9P97762 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
rp9P97762 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
rp9P97762 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
rp9P97762 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
rp9P97762 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
rp9P97762 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
rp9P97762 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
rp9P97762 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
rp9P97762 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
rp9P97762 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
rp9P97762 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
rp9P97762 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
rp9P97762 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
rp9P97762 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
rp9P97762 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
rp9P97762 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms