Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf1bP97358 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms