Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pkp1P97350 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms