Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3f3aP84244 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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