Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Ptprn2P80560 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Ptprn2P80560 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Ptprn2P80560 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ptprn2P80560 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ptprn2P80560 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ptprn2P80560 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ptprn2P80560 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ptprn2P80560 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ptprn2P80560 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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