Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms