Protein–RNA interactions for Protein: P70459

Erf, ETS domain-containing transcription factor ERF, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErfP70459 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ErfP70459 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ErfP70459 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ErfP70459 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ErfP70459 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ErfP70459 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ErfP70459 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ErfP70459 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ErfP70459 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ErfP70459 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ErfP70459 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ErfP70459 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ErfP70459 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ErfP70459 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ErfP70459 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ErfP70459 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ErfP70459 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ErfP70459 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ErfP70459 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ErfP70459 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ErfP70459 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ErfP70459 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ErfP70459 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ErfP70459 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ErfP70459 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ErfP70459 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ErfP70459 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ErfP70459 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ErfP70459 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ErfP70459 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ErfP70459 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ErfP70459 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ErfP70459 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ErfP70459 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ErfP70459 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ErfP70459 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ErfP70459 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ErfP70459 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ErfP70459 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ErfP70459 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ErfP70459 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ErfP70459 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ErfP70459 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ErfP70459 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ErfP70459 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ErfP70459 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ErfP70459 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ErfP70459 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ErfP70459 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ErfP70459 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ErfP70459 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ErfP70459 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ErfP70459 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ErfP70459 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ErfP70459 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ErfP70459 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ErfP70459 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ErfP70459 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ErfP70459 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ErfP70459 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ErfP70459 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ErfP70459 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ErfP70459 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ErfP70459 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ErfP70459 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ErfP70459 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ErfP70459 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ErfP70459 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ErfP70459 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ErfP70459 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ErfP70459 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ErfP70459 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ErfP70459 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ErfP70459 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ErfP70459 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ErfP70459 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ErfP70459 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ErfP70459 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ErfP70459 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ErfP70459 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ErfP70459 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ErfP70459 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ErfP70459 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ErfP70459 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ErfP70459 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ErfP70459 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ErfP70459 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ErfP70459 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ErfP70459 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ErfP70459 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ErfP70459 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ErfP70459 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ErfP70459 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ErfP70459 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ErfP70459 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ErfP70459 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ErfP70459 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ErfP70459 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ErfP70459 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ErfP70459 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms