Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp9xP70398 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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