Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shox2P70390 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shox2P70390 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Shox2P70390 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shox2P70390 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shox2P70390 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shox2P70390 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shox2P70390 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms