Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msx3P70354 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx3P70354 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx3P70354 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx3P70354 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx3P70354 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Msx3P70354 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msx3P70354 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms