Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad1P70340 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad1P70340 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smad1P70340 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad1P70340 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad1P70340 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms