Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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Hoxd13P70217 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Hoxd13P70217 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Hoxd13P70217 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Hoxd13P70217 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Hoxd13P70217 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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Hoxd13P70217 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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Hoxd13P70217 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Hoxd13P70217 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Hoxd13P70217 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Hoxd13P70217 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Hoxd13P70217 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Hoxd13P70217 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Hoxd13P70217 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Hoxd13P70217 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Hoxd13P70217 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Hoxd13P70217 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Hoxd13P70217 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Hoxd13P70217 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd13P70217 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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