Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tuba4aP68368 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba4aP68368 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms