Protein–RNA interactions for Protein: P62965

Crabp1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crabp1P62965 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Crabp1P62965 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Crabp1P62965 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms