Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms