Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd6P61407 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd6P61407 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd6P61407 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd6P61407 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd6P61407 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd6P61407 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd6P61407 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd6P61407 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tdrd6P61407 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tdrd6P61407 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms