Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg6P61406 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg6P61406 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg6P61406 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg6P61406 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smg6P61406 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smg6P61406 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smg6P61406 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg6P61406 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg6P61406 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg6P61406 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms