Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ppfia3P60469 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms