Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr3bP59470 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms