Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms