Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd4P58467 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd4P58467 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd4P58467 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd4P58467 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd4P58467 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Setd4P58467 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms