Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf2P58021 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms