Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Samsn1P57725 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samsn1P57725 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms